Ke změnám dochází na základě vývoje mezikrajské spolupráce s Jihomoravským krajem a Krajem Vysočina, kde od 1. 5. 2025 dochází k zahájení plnění nových závazkových smluv na veřejnou linkovou dopravu pro oblasti Moravskobudějovicko a Třebíčsko a bylo ze strany Jihočeského kraje potřebné reagovat na žádoucí přesuny výkonů mezi jihočeskými linkami a linkami Kraje Vysočina v souvislosti s počátkem provozu nových závazkových smluv v Kraji Vysočina. Na straně Jihočeského kraje došlo k nejzásadnějším změnám na linkách 379, na níž došlo především k úpravám trasování některých spojů s ohledem na změny na linkách v objednávce Kraje Vysočina, a 364, která byla ve spolupráci s dotčenými obcemi zatraktivněna – došlo převážně k úpravám časů odjezdů a prodloužení některých spojů. K dílčím změnám došlo i na linkách 343, 357, 366, 370, 376 a 377. Přehled změn platných od 1. 5. 2025 na linkách v závazku veřejné služby naleznete ZDE.